Veja alguns casos de descarrilamento de composições da empresa:
23 de julho de 2000 Seis vagões carregados com óleo diesel descarrilam e pegam fogo em Fernandes Pinheiro, nos Campos Gerais. Segundo o Instituto Ambiental do Paraná, 60 mil litros vazam e atinge nascente de rio. Dias depois, outro descarrilamento resulta em vazamento de 20 mil litros de óleo diesel e gasolina na mesma região.
23 de setembro de 2000 Trinta vagões carregados com açúcar descarrilam em Morretes. Segundo os órgãos ambientais, 4 mil litros de combustível vão parar no córrego Caninana.
30 de maio de 2003 Após descarrilamento de vagões, 60 mil litros de óleo diesel vazam entre Ibiporã e Jataizinho, no Norte do Paraná.
28 de março de 2004 Um vagão descarrila e derrama 350 toneladas de soja, farelo de soja e milho a granel no Córrego Caninana, afluente do Rio Nhundiaquara, na Serra do Mar.
19 de julho de 2004 No maior acidente ferroviário da história do Paraná, 35 vagões carregados de soja, farelo de milho e açúcar descarrilam sobre a ponte do Rio São João, em Morretes.
15 de setembro de 2004 Cerca 500 litros de óleo diesel vazam em acidente em Rio Negro, divisa com Santa Catarina. Doze vagões descarrilam.
17 de julho de 2006 Dois vagões descarrilam e a locomotiva da composição que leva 700 toneladas de cimento tomba, a cerca de 4 km do centro de Almirante Tamandaré.
3 de fevereiro de 2008 Dois vagões carregados com etanol descarrilam em Ortigueira.
20 de março de 2008 Um maquinista e o auxiliar morrem após o descarrilamento de uma locomotiva no município de Água Clara (MS). A causa teria sido o excesso de água da chuva na ferrovia.
29 de janeiro de 2009 A forte chuva provoca o descarrilamento de um trem de carga com 62 vagões no trecho entre as cidades gaúchas de Pelotas e Capão do Leão. O maquinista morre.
4 de fevereiro de 2009 Cinco vagões carregados com álcool e dois com óleo vegetal tombam às margens da ferrovia que corta Sorocaba (SP).
5 de fevereiro de 2009 Composição tomba no perímetro urbano de Cambará, provocando vazamento de álcool e explosões.
